牡丹品種分類方法很多，可按用途分，可按花的形態(tài)分，可按開花早晚分，可按花的顏色分。昔張峋撰花譜，以花有千葉、多葉之不同創(chuàng)立分類；清余扶伯撰“曹州牡丹譜”，分正色、間色。正色黃為中央首列之；次青、紅、白、黑；間色粉、紫、綠三種又次于后，凡五十六種。按中國故有傳統(tǒng)習(xí)慣，多以色別，當(dāng)?shù)剞r(nóng)民也是根據(jù)品種色澤不同把它們分成白、黃、粉、紅、紫、黑、綠、藍(lán)八類。為了應(yīng)用方便，作者進(jìn)行一下之分類:

　　按花的形態(tài)分:曹州牡丹按其花的形態(tài)不同可以分為單瓣種（單葉）；半重瓣種（多葉）和重瓣種（千葉）三類。單瓣種-僅有一層寬大的花瓣，在花心擁有雌蕊和多數(shù)的雄蕊。半重瓣種-有數(shù)層花瓣，花心擁有雌蕊和多數(shù)的雄蕊或花心常出現(xiàn)與花瓣相似的雄蕊。重瓣種-花心內(nèi)所有的或幾乎所有的雄蕊均變成花瓣狀。

　　曹州牡丹因系栽培種，絕大多數(shù)品種均屬于后兩類，只是極個別品種為單瓣種，也有些品種在最初開花時或生長發(fā)育不良時開單瓣花，有時在同一植株上也會出現(xiàn)三種不同的花形，有重瓣的，半重瓣的和單瓣的。

　　重瓣花又可分為玫瑰花型的，球型的和皇冠型的。玫瑰花型的重瓣花，花千葉，大開頭，無論內(nèi)部和外部都有很大的彼此密接的花瓣。這一類型的牡丹花具有最美麗的花形，例如胡紅、百花妬、春紅爭艷、第一嬌、瑤池春等。

　　球型的重瓣花，同樣也是千葉的，但他們內(nèi)部的花瓣形成球狀，突起在外部的寬大的花瓣之上。例如脂紅、白玉、葛巾紫、種生紅、銀粉金麟、瓔珞寶珠等。

　　皇冠型的重瓣花，花微重瓣，有寬大的外瓣，內(nèi)部細(xì)碎的、散亂的花瓣形成類似皇冠型的花心。一朵花常常出現(xiàn)兩色，外部花瓣是一色，內(nèi)部花瓣是一色，例如斗珠、深黑紫、烏龍臥墨池、赤龍煥彩、嬌容三變等。

　　按栽培用途分:曹州栽培牡丹其用途主要有二:一為生產(chǎn)地下部的根供藥用；二為大量繁殖和培育新品種供綠化觀賞用。

　　適于根用的品種-趙粉、朱砂壘、假葛巾紫、墨魁、白玉、紫重樓、種生黑、紫繡球、紫金荷、圣誕樓、小魏紫、第一嬌、冰凌罩紅石、青龍臥墨池等。

　　觀賞價值較高的品種-掌花案、梨花雪、金輪黃、趙粉、胡紅、豆綠、姚黃、白玉、墨魁、鶴白、昆山夜光、冰凌罩紅石、銀粉金麟、第一嬌、酒醉?xiàng)铄?、似荷蓮、一品朱衣、春紅爭艷、百花妬、狀元紅、十八號、瓔珞寶珠、丹皂流金、平西艷、脂紅、胭脂紅、首案紅、種生紅、二喬、朱砂壘、大魏紫、大棕紫、趙紫、邦寧紫、凌花曉翠、葛巾紫、赤龍煥彩、王紅、紫重樓、煙龍紫珠盤、烏龍臥墨池、種生黑、墨撒金、藍(lán)田玉、瑤池春、嬌容三變等。

　　按開花早晚分:

　　早開花種-石園白、清心白、趙粉、朱砂壘、春紅爭艷。

　　晚開花種-銀粉金麟、昆山夜光、赤龍煥彩、烏龍臥墨池、葛巾紫、第一嬌、胡紅、寶樓臺、西子、斗珠、豆綠、美人紅、羅漢紅、雞爪紅、紫云仙、圣誕樓、勝丹爐等。

　　中開花種-冰棱罩紅石、姚黃、白玉、似荷蓮、狀元紅、梨花雪、掌花案、金輪黃、紫金荷、藍(lán)田玉、脂紅、二喬、墨魁、潑墨紫、丹爐焰、深黑紫、紫重樓、海棠爭潤、瓔珞寶珠、十八號、嬌容三變、邦寧紫、烏龍捧勝、茄蘭丹砂、金玉其、酒醉?xiàng)铄?、種生紅、煙龍紫珠盤、賽珠盤、種生黑、國色無雙、大魏紫、青龍臥墨池等。

　　按花的顏色分:

　　梨花雪-枝枯瘦，生長慢，矮生。

　　昆山夜光-植株高大，新枝青綠色，略帶污紫色斑點(diǎn)。節(jié)間長，葉稀大。

　　白玉-新枝綠色或黃綠色，葉稀大，長尖，呈長卵圓形，倒卵圓形，黃綠或綠色，微向上反卷，背面綠色。

　　鶴白-枝粗壯，直生。新枝紫綠色，基部紫紅。葉小，短肥，團(tuán)尖，呈長卵圓形，頂端三裂掌狀，基部全綠，葉面粗皺，黃綠色。